Узбекистанский художник. В 1962 году поступил во Фрунзенское художественное училище (ныне Кыргызское государственное художественное училище им. С. А. Чуйкова). В 1979 году окончил Московский Государственный академический институт им. В. И. Сурикова (живописное отделение, мастерская Д. К. Мочальского). Работы Ахунова выставлялись на 5‑й Московской биеннале современного искусства, в Павильоне Центральной Азии на 51‑й, 52‑й и 55‑й Венецианской биеннале современного искусства, 1‑й Киевской биеннале, documenta 13 в Касселе, Монреальской биеннале 2007 года, 1‑й Сингапурской биеннале, выставках «Ostalgia» в Новом музее современного искусства в Нью‑Йорке (2011) и «Time of the Storytellers» в музее современного искусства Киасма в Хельсинки (2007). С 1980 года живёт и работает в Ташкенте.