В 1983 году окончил Московский институт связи. До 1990 года работал в Кишинёве заведующим лабораторией, инженером, директором «Центра научно‑технического творчества молодёжи». В 1990 году переехал в Москву и основал одну из первых частных галерей в бывшем СССР — Галерею Марата Гельмана, впоследствии -галерея «М&Ю Гельман». В 2002–2004 годах филиал галереи работал также в Киеве. В марте 2009 года продал 50 % своей галереи коллекционеру Александру Смузикову в связи с назначением директором Пермского музея современного искусства PERMM. В 2012 году сообщил о закрытии галереи «М&Ю Гельман». В 2012 году создал новую институцию — «Культурный альянс. Проект Марата Гельмана», она существовала до 2015 года. В 2013 году был уволен с поста директора PERMM. В 2014 году переехал в Черногорию, в 2015 году открыл в городе Будва арт‑резиденцию «Dukley European Art Community», вместе с Нэйлом Эмильфарбом и Петаром Чуковичем. С 2018 года проводит в Будве Форум Русской Культуры в Европе «СловоНово». Живёт и работает в Будве, Черногория. Внесён Министерством юстиции Российской Федерации в список иноагентов в 2021 году.