Первый музей современного искусства Турции был создан благодаря доктору Неджат Ф. Эджзаджибаши и Оя Эджзаджибаши в 2004 году. Первоначально музей располагался в здании, построенном как склад сухих грузов для Турецкой морской организации под руководством архитектора Седада Хаккы Элдема во время реконструкции площади Топхане в 1957–1958 годах и преобразованном архитекторами Tabanlıoğlu в 2004 году специально для музея. С 2018 по 2022 год Istanbul Modern размещался во временном помещении. В 2023 году музей переехал в новое здание, спроектированное Renzo Piano Building Workshop и возведённое на месте прежнего.
Собрание музея представляет преимущественно работы художников из Турции, но в нём можно найти и работы известных зарубежных авторов. В собрании можно отдельно выделить коллекцию фотографии. Помимо выставочной деятельности музей реализует образовательные и социальные проекты. В музее есть также библиотека, кинотеатр, ресторан и магазин.