Следственная тюрьма НКВД — первый музей в стране, посвященный истории советских массовых репрессий. Музей расположен в подвальном помещении здания, в котором в 1923–1944 годах находилась внутренняя тюрьма Томского городского отдела ОГПУ‑НКВД. До революции здесь размещалась церковно‑учительская школа. В ноябре 2022 года после масштабной модернизации в музее снова открылась постоянная экспозиция. В ходе модернизации в музее были воссозданы объемы девяти тюремных камер. Одна из камер музеефицирована в первоначальном виде, а в остальных размещены тематические залы, рассказывающие об истории массовых репрессий в СССР. С особым вниманием авторы экспозиции отнеслись к наследию репрессий на территории современной Томской области. Посетителей ждёт рассказ об истории Чаинского восстания, Назинской трагедии, массовых арестах в селе Белосток, расстрельных полигонах близ горы Каштак и в Колпашево.
